Statystyki dotyczące nowotworu piersi

Jakiś czas temu agencja ExpertPR poprosiła naszą Fundację o zaprezentowanie statystyk dotyczących nowotworu piersi w Polsce. Temat bardzo mnie zainteresował (spędziłem w przeszłości kilka lat na współpracy z onkologami w analizie danych dotyczących nowotworów). Przygotowaliśmy więc prezentację, a Pani Prezes ją przedstawiła.

Dziś chciałbym w skrócie tę prezentację zaprezentować na blogu.

Link do prezentacji znajduje się tutaj. Poniżej prezentowane wykresy są ,,klikalne” i przekierowują na wskazaną stronę prezentacji. Cała prezentacja została wykonana w czystym R [o technikaliach napiszę więcej w czwartek].

W prezentacji przedstawione są wybrane informacje o epidemiologii choroby, o postępach w walce z tą chorobą i o postrzeganiu tej choroby [wybrane, temat jest zdecydowanie szerszy niż pozwalała na jego omówienie półgodzinna prezentacja]. Poniżej przedstawiam cztery wybrane slajdy.

Rośnie liczba zdiagnozowanych przypadków raka piersi

Jak widzimy na poniższym wykresie liczba zdiagnozowanych przypadków szybko rośnie. Ta informacja ma pozytywny wydźwięk. Dlaczego? Rosnąca liczba zdiagnozowanych przypadków jest związana z coraz wcześniejszym wykrywaniem nowotworu. A to z kolei znacząco zwiększa szansę na powodzenie leczenia.

Rośnie liczba artykułów na temat raka piersi

I artykułów naukowych (jest to bardzo gorąca dziedzina badań) i artykułów ,,popularnonaukowych”. To również pozytywne zjawisko. Jednym z problemów pacjentów jest trudność w dotarciu do informacji o chorobie, niepewność, jak leczenie wygląda w Polsce. Większa dostępność informacji o chorobie pomaga chorym przynajmniej w tym aspekcie.

Media społecznościowe a rak piersi

Okazuje się, że media społecznościowe spełniają ważną rolę grupy wsparcia dla osób chorych. Nie mówią tu o akcjach typu klikamy ,lubię tu’, ale o miejscu gdzie osoby chore mogą się spotkać i podzielić obawami/przeżyciami/pytaniami.

Zaskoczony byłem, że np. na Twitterze funkcjonuje kanał #BCSM (Breast Cancer Social Media), na którym organizowane są wideo konferencje, odczyty, przemowy zaproszonych osób. W trakcie takiej konferencji na wskazanym kanale słuchacze dzielą się komentarzami.

Podobne inicjatywy można spotkać na innych mediach.

Przeżywalność 5-letnia a różne czynniki

Nikt nie wie jak potoczą się losy konkretnego chorego. Ale patrząc na średnie można odczytywać jak szanse na przeżycie np. pięciu lub dziesięciu lat zmieniają się w zależności od wielkości i złośliwości odkrytego guza. Zupełnie zgodne z oczekiwaniami jest to, że guzy wcześnie wykryte znacznie lepiej rokują, jeżeli chodzi o szanse leczenia. Ale o ile lepiej i jakie są ,,wyjściowe” szanse?

Więcej informacji można znaleźć w cytowanej prezentacji.

Edytor zbliżeniowy i opowiadanie historii, czyli ceny aut używanych w segmencie C część 3

Ostatnio, w tym wpisie, przedstawiałem wizualizacje cen aut używanych z segmentu C. Obiecałem też przedstawienie tych wizualizacji w postaci prezentacji. Złożyłem ta obietnicę celowo, by mieć pretekst do przetestowania programu ze strony prezi.com, reklamowanego jako ,,zooming presentation editor”. Dotąd przygotowywałem prezentacje w Beamerze i byłem z nich zadowolony, ale warto testować nowe rozwiązania.

Prezentacje wykonane w programie prezi wyglądają jak seria zbliżeń jednego dużego rysunku, przez co ma się wrażenie ciągłości historii i łatwiej zbudować w głowie mapę prezentacji. Edytor prezi jest dosyć ograniczony (we flashu można zrobić więcej), ale łatwo i intuicyjnie się go używa, wyniki są też dosyć przyjemne dla oka. Oczywiście aby wrażenie ciągłości i spójności pojawiło się w głowie odbiorcy, trzeba poświęcić trochę czasu na projektowanie prezentacji, więcej niż w przypadku zwykłych slajdów.

Prezentację z dodanym głosem umieszczam poniżej (nagrana z ekranu za pomocą programu Camtasia, wersja 30 dniowa). Zależało mi bardziej na zaprezentowaniu efektu zbliżeń niż na budowaniu emocjonującej historii, więc proszę wybaczyć usterki w audio i brak porywającej narracji. W każdym razie moje wrażenia po wykonaniu pierwszej prezentacji z użyciem ,,edytora zbliżeniowego” są bardziej niż pozytywne.

Może by w ten sposób przygotować materiały wideo do kursu ze statystyki?

(Jeżeli poniżej nie otwiera się materiał wideo, to proszę kliknąć na ten link)
 

Szkoła Infografiki a moja prezentacja

W poprzedni czwartek 22 marca miałem przyjemność poprowadzić godzinną prezentację nt. dobrych i złych wykresów. Prezentacja miała miejsce w ramach warsztatów organizowanych przy Szkole infografiki. Szkoła infografiki jest projektem prowadzonym przez Centrum Cyfrowe projekt” Polska.

Spotkanie odbyło się w klubokawiarni na Chłodnej 25. Okazuje się, że w piwnicach jest sala na około 50 osób z projektorem i ekranem. Kawa jest bardzo dobra i znacznie tańsza niż w centrum. Więc wygląda to jak bardzo ciekawe miejsce na spotkania warsztatowe niewielkich grup. Polecam.

Mnie się spotkanie bardzo podobało, choć jako prezentujący mogę mieć spaczone wrażenie. Zainteresowanych osób było sporo, ścisłowców było mało ale byli, byli też prawdziwi dziennikarze, tym ciekawiej spojrzeć na jakiś temat z innej strony. Kolejną prezentację, mniej więcej za miesiąc, ma poprowadzić specjalistka od grafiki i informacji z ASP w Katowicach, również polecam.

Więcej informacji Szkole infografiki i podobnych projektach można znaleźć tutaj.

Więcej informacji o think-tanku (zna ktoś jakieś dobre, czyli niedosłowne, tłumaczenie?)  Centrum Cyfrowe projekt: Polska tutaj.

Więcej informacji o klubokawiarni na Chłodnej znajduje się tutaj.

Klikając na poniższy slajd można pobrać moją prezentację (uwaga, ponad 10MB).

Spotkanie było też nagrywane i pewnie na stronach Centrum pojawi się kiedyś odnośnik do nagrania.

AKTUALIZACJA: Link do nagrania z warsztatów.

 

Szkoła Infografiki, 22 III 2012, klubokawiarnia Chłodna 25

Centrum Cyfrowe organizuje czteromiesięczne bezpłatne szkolenie o nazwie ,,Szkoła inforgrafiki”. Więcej o tym projekcie przeczytać można tutaj.

W ramach tej szkoły planowane są między innymi comiesięczne otwarte dla wszystkich pogadanki/przentacje. Poproszono mnie o poprowadzenie najbliższej, mniej więcej godzinnej pogadanki, która rozpocznie się 22 marca o godzinie 19 w klubokawiarni Chłodna 25.
No cóż, spróbujmy!
Zgłoszony temat to ,,Nie daj się oszukać wykresom”. Planuję pokazać kilka złych wizualizacji, przy czym pisząc złych mam na myśli wprowadzających w błąd. Do tego kilka popularnych reguł na co uważać przygotowując infografikę oraz kilka grafik, które wykonane były lata temu a wciąż są flagowym przykładem czytelnej reprezentacji złożonych danych.

Poniżej umieszczam pierwsza stronę prezentacji.

Flaszki i Studencki Festiwal Informatyczny

W najbliższym miesiącu opowiem coś na dwóch imprezach, które mają bardzo ciekawą formę. Dziś napiszę kilka zdań o obu imprezach i też powiem o czym będę na nich mówił. Pierwsza  z imprez ma miejsce w Warszawie, druga w Krakowie.

Warszawska nazywa się Flaszki. Link do strony imprezy znajduje się tutaj. Organizowana jest przez samorząd studentów wydziału Matematyki Informatyki i Mechaniki Uniwersytetu Warszawskiego, czyli MIMUW. Spotkanie składa się ze zbioru krótkich (zgodnie ze stroną 5 minutowych) wystąpień na tematy interesujące dla występującego. Na wskazane stronie są (a przynajmniej jest jeden) plik video z prezentacjami z poprzednich edycji. Nie jest to TED ale może być fajnie. Najbliższe flaszki są 29 lutego 2012, od 18:30, na Wydziale Chemii UW. 

Ja akurat za temat wybrałem ,,Mądrzejsza Polska a przyjemność z szukania dziury w całym” i mam zamiar opowiedzieć o tym jaka to frajda tropić błędy na wykresach. Kto wie, może taki ,,data hacking” rozwinie się.

 

Drugie wystąpienie planowane jest na 8 Studenckim Festiwalu Informatycznym. Tym razem forma dłuższa, 45-60min. Temat to ,,Życie w ocenie danych, wczoraj dziś i jutro”. Mam zamiar pokazać kilka przykładowych analiz danych o różnych rozmiarach, począwszy od małych ankiet kilkudziesięciu liczb aż do zbiorów danych ważących 20 TB. Link do festiwalu znajduje się tutaj. Festiwal trwa trzy dni, ja najprawdopodobniej będę mówił 9 marca. Na festiwal zaproszonych jest kilka ciekawych osób, więc myślę, że warto się tam wybrać i posłuchać co w trawie piszczy. Na stronie festiwalu przedstawione są informacje o wydarzeniach związanych z festiwalem. Urzekł mnie wpis poświęcony opisowi odmownej odpowiedzi Donalda Knutha, wpis ten można zobaczyć tutaj.

Poniżej pierwsza strona planowanej prezentacji.

zanuRkuj w R

Zostałem zaproszony do wygłoszenia referatu na seminarium poświęconym analizie danych. A ponieważ zapraszającym był sam Paweł Cichosz więc nie sposób było odmówić.

Seminarium odbędzie sie dziś o 12:15 (Gmach Elektroniki PW, sala 229 II piętro). Przy okazji powstała prezentacja, która może zaciekawi szersze grono odbiorców.

 

Slajdy są dostępne tutaj, kod w programie R jest dostępny tutaj.

Prezentacja miała nie być o statystyce, ale o języku R. Na omówienie języka jedno seminarium nie wystarczy, dlatego wybrałem siedem ciekawszych i bardziej zaawansowanych mechanizmów języka R. Dotyczą one takich aspektów jak waga atrybutów, funkcyjność, leniwa ewaluacja, przestrzenie nazw, profilowanie kod, automatyczne generowanie raportów z użyciem Sweave. Napisałem ,,zaawansowanych'; ponieważ nie są one omawiane w większości opracowań dotyczących R, a są moim zdaniem ciekawe i warto być ich świadomym.